Ausstattung
Unsere Core Facility bietet drei individuelle Serviceplattformen an. Die Spatial Omics Platform ermöglicht die Detektion räumlicher Transkriptome mit Xenium (10X Genomics) und CODEX (Akoya Biosciences). Unsere High-Throughput Liquid Handling Plattform bietet eine kostengünstige und benutzerfreundliche automatisierte Pipeline, bestehend aus einem CyBio Well Vario (Jena Analytik), einem D300e Digital Dispenser (Tecan) und einem Multidrop Dispenser (Thermo Fisher Scientific). Die Hochdurchsatz-Readout-Plattform besteht aus dem Opera Phenix (Perkin Elmer) und dem Incucyte SX5 (Sartorius).
Xenium von 10X Genomics ist eine räumliche Transkriptomik-Plattform für die hochauflösende in-situ Genexpressionsanalyse. Unter Verwendung von kundenspezifischen oder standardisierten Genpanels können Anwender RNA-Transkripte von Hunderten bis zu mehreren Tausend Genen direkt in formalinfixierten, paraffineingebetteten (FFPE) oder frisch gefrorenen Gewebeproben visualisieren und quantifizieren.
PhenoImager Fusion™ ermöglicht die automatisierte Anwendung von CODEX (CO-Detection by Indexing) auf herkömmlichen Mikroskop-Objektträgern. Durch die Verwendung von DNA-konjugierten Antikörpern ist die gleichzeitige Detektion von bis zu 80 Proteinen in sowohl formalin-fixierten, paraffin-eingebetteten (FFPE) als auch frisch gefrorenen Gewebeproben möglich. Mehrere umfassende Färbepanels stehen zur Verfügung, die je nach wissenschaftlichem Projekt und Gewebetyp individuell angepasst werden können.
Der CyBio Well Vario von Analytik Jena ist ein modulares, hochpräzises Liquid-Handling-System für das automatisierte Pipettieren im Hochdurchsatz-Screening, in der Assay-Entwicklung und in der Probenvorbereitung. Es verfügt über mehrere wichtige Funktionalitäten:
- Kundenspezifischer automatisierter Simultanpipettierer mit 8 verschiedenen Arbeitsstationen
- Pipettieren bis 250 µL auf einer Plattform mit 96 oder 384 Wells.
Der digitale Dispenser D300e von Tecan ist ein Dispenser für Flüssigkeiten im Nano- bis Mikroliterbereich, der für die präzise, berührungslose Dosierung kleiner Flüssigkeitsmengen wie Arzneimittel, Reagenzien und biologische Proben entwickelt wurde. Er kann Reagenzien in eine Platte mit bis zu 1536 Wells dosieren.
Der Multidrop Dispenser ist ein Reagenzien-Dispenser für die schnelle und hochvolumige Dosierung von Flüssigkeiten in 96-, 384- und 1536-Well-Platten. Er wird häufig in der Arzneimittelforschung, Genomik, Proteomik, ELISA und Zellkulturanwendungen eingesetzt.
Das Opera Phenix High-Content Screening System von PerkinElmer ist ein hochmodernes Bildgebungssystem, das speziell für die schnelle und hochauflösende Fluoreszenzbildgebung entwickelt wurde. Es ermöglicht die multiparametrische Bildgebung komplexer Zellmodelle, einschließlich 3D-Sphäroiden, Organoiden und Co-Kultur-Assays. Zu den Hauptmerkmalen des Opera Phenix gehören
- Vier Laser, die mehrere Fluoreszenzmarker erfassen können
- Simultane Zweikanal-Bildgebung zur Reduzierung der Phototoxizität und Beschleunigung der Bildaufnahme
- Drei Wasserimmersionsobjektive zur Verbesserung der Lichtsammlung und Auflösung
- Möglichkeit zur Durchführung von Bildaufnahmen in Platten mit bis zu 384-Well-Platten.
- KI-basierte Bildanalyse für Zellsegmentierung, Morphologieanalyse und phänotypisches Profiling.
Das Incucyte SX5 von Sartorius ist ein Live-Cell-Imaging- und Analysesystem, das für die automatisierte Echtzeitüberwachung von Zellkulturen in einem Standardinkubator entwickelt wurde. Diese stabile Kulturumgebung ermöglicht die Langzeitbeobachtung von Zellwachstum, morphologischen Veränderungen, Apoptose, Migration und Invasion. Zu den wichtigsten Merkmalen des Incucyte SX5 gehören:
- Kontinuierliche Bildaufnahme über Stunden, Tage oder Wochen.
- Drei Fluoreszenzkanäle für Multiplex-Bildgebung.
- Gleichzeitige Überwachung von bis zu sechs 384-Well-Platten.
