Leistungen

Die CUBI bietet sowohl standardisierte als auch projektspezifische Analysen an. Dabei liegt der Fokus auf in der Bioinformatik fest etablierter Software wie den Systemen Snakemake und Nextflow für wohldefinierte Standardanalysen („workflows“) und den Skriptsprachen Python und R für projektspezifische Lösungen. 

Auf Wunsch kann versucht werden, publizierte Software von Dritten auf der lokalen Infrastruktur einzusetzen. Die Expertise der CUBI umfasst im Kern die umfassende Analyse von Sequenzierdaten (kurze und lange Reads; bulk, single cell und spatial) in den Bereichen Genomik, Epigenomik und Transkriptomik. Bei anderen Datentypen nehmen wir Aufträge ggf. nach einer internen Evaluierung an. Wir bitten grundsätzlich darum, bereits im Planungsstadium neuer Projekte eine kostenfreie Beratung durch die CUBI in Anspruch zu nehmen. 

Wir weisen darauf hin, dass die Mitarbeitenden der CUBI auf allen IT-Systemen am Standort den allgemein gültigen Nutzungsbeschränkungen unterliegen. Daraus folgt, dass die CUBI grundsätzlich keine Projekte betreuen kann, die den Betrieb von Infrastruktur in Hardware oder Software erfordern und dass die CUBI keine Leistungen zum Forschungsdatenmanagement anbietet.